Кровь и мазки, взятые с поверхности тела рыбы и жабр, микроскопируют. После этого вырезают и исследуют жабры более внимательно.
     Вначале рассматривают под лупой жаберные дуги, затем отдельные участки жаберных лепестков и жаберных дуг изучают под микроскопом без покровного стекла. Отдельные участки жаберных лепестков раздавливают между двумя стеклами и исследуют. Обращают внимание на деструктивные изменения жабр и жаберных лепестков и наличие паразитов.
     После исследования наружных покровов и жабр рыб вскрывают и осматривают внутренние органы на присутствие паразитов.
     Затем анализируют все полученные данные и делают заключение о санитарном и эпизоотическом состоянии как отдельных обследованных прудов (водоемов), так и хозяйства в целом, о полноте, правильности и своевременности выполнения профилактических, лечебных и оздоровительных мероприятий, а также о выполнении ветеринарно-санитарных требований при строительстве, эксплуатации рыбоводного хозяйства, перевозках, пересадках и выращивании рыб.
     В течение всего процесса обследования хозяйства ветврач записывает полученные данные в рабочую тетрадь или блокнот. После обследования хозяйства составляют акт.
     При обследовании основное внимание уделяют санитарному и эпизоотическому состоянию хозяйства, своевременности и качеству выполняемых мероприятий, предусмотренных планом или рекомендованных специалистами в предыдущих проверках, правильности проведения и оформления перевозок рыб.
     Результаты проведенного обследования в краткой форме заносят в ветеринарно-санитарный паспорт хозяйства, а также журнал учета ветеринарно-санитарных мероприятий.